Listopad 2012 r. jako trener GKS Bełchatów (obok ówczesny trener Widzewa Radosław Mroczkowski). Pracował w tym klubie od 14.11.2012 do 21.12.2012

Trenerem Lechii Gdańsk był od 4 czerwca 2013 do 26 marca 2014

Po raz drugi pracę trenerską w Jagiellonii Białystok zaczął 7 kwietnia 2014 i trwała ona do 4 czerwca 2017. W sezonie 2014/15 zdobył 3. miejsce w ekstraklasie, w sezonie 2016/17 wicemistrzostwo Polski

Trenerem Cracovii jest od 21 czerwca 2017. Ma ważny kontrakt do 30 czerwca 2023. 30 stycznia 2021 roku podał się do dymisji. W sezonie 2018/2019 wywalczył z "Pasami" 4. miejsce w lidze, w sezonie 2019/2020 wywalczył Puchar Polski i Superpuchar Polski.