WISŁA KRAKÓW juniorzy
Po zakończeniu kariery zawodniczej w Nadwiślanie Kraków pierwszą pracą Wojciecha Stawowego była praca w Wiśle Kraków z zespołami młodzieżowymi, którą podjął w 1992 r. Opieka nad zespołem juniorów Wisły Kraków zaowocowała dwoma mistrzostwami Polski w 1996 i 1997 r., a rok później przyniosła brązowy medal. wychował takich zawodników jak Szkoleniowiec prowadził też rezerwę tego klubu
PROSZOWIANKA
Po odejściu z Wisły latem 1999 r. został trenerem Proszowianki, występującej w III lidze. Zespół zajął kolejno przez trzy sezony piąte, piąte i trzecie miejsce. Ofensywny styl, bazowanie na zawodnikach z Krakowa i okolic, głównie juniorach Wisły, zaowocowało zainteresowaniem ze strony mającej awansowe aspiracje Cracovii. Po trzech sezonach w Proszowicach Stawowy przeniósł się do "Pasów"
CRACOVIA
1 lipca 2002 nastąpił najlepszy okres w karierze szkoleniowca. Zabrał się do pracy u podstaw i zaczął budować w Cracovii drużynę opartą na swoich wychowankach - Łukaszu Skrzyńskim, Krzysztofie Radwańskim, Wojciechu Ankowskim, Pawle Nowaku, Krzysztofie Piszczku. Z Proszowianki trafili też Tomasz Siemieniec, Marcin Dudziński. Po roku pracy mógł świętować awans do drugiej ligi, a po kolejnym roku do pierwszej, czyli ekstraklasy. W pierwszym po powrocie sezonie do najwyższej klasy rozgrywkowej zespół pod jego wodzą był o krok od udziału w pucharach. Skończyło się na 5. miejscu. w styczniu 2006 r. podpisał nowy 10-letni kontrakt, który przestał obowiązywać miesiąc później. stawowy domagał się dodatkowego obozu dla piłkarzy, na co nie godziło się kierownictwo klubu. Uniósł się honorem i zrezygnował.
