O śmierci Janusza Wójcika poinformował na Twitterze dziennikarz Jacek Kmiecik, a potwierdził dla portalu sportowefakty.pl syn trenera, Andrzej Wójcik. Szkoleniowiec miał poważne problemy ze zdrowiem od kilku lat.
W latach 1989–1992 był trenerem piłkarskiej reprezentacji olimpijskiej, z którą zdobył srebrny medal podczas igrzysk w Barcelonie. Pięć lat później objął reprezentację Polski seniorów, którą prowadził przez dwa lata w trakcie eliminacji do mistrzostw Europy 2000.
W połowie lat 80. trenował zespół Hutnika Kraków w rozgrywkach II ligi (obecna I liga). W 1987 roku awansował z Jagiellonią Białystok do ekstraklasy, a w 1993 roku uzyskał z Legią Warszawa tytuł wicemistrza Polski (mistrzostwo zostało odebrane drużynie przez PZPN). Ostatnim klubem, w którym pracował był Widzew Łódź (2008).